Впервые школа в с. Верхотор была открыта в 1887 году – начальная церковно-приходская. Современное здание было построено в 1971 году. Открытие школы было приурочено к 7 ноябрю, но занятия начались в декабре месяце. Директором этой новой школы был назначен Сергейчев Илья Егорович. 30 лет был бессменным директором Мичурин Иван Тимофеевич. В 2010 г. он передал бразды правления Попковой Татьяне Николаевне.
